新疆是大陆性气候新疆巴旦杏品种繁多，约有四十多个，分为五个大家族，分别是软壳甜巴旦杏品系、甜巴旦杏品系、厚壳甜巴旦杏品系、苦巴旦杏品系、桃巴旦杏品系。
“纸皮”，又名露仁。坚果长椭圆形，果壳薄，壳软，平均重1.3至1.4克，仁重0.6至0.8克，出仁率48.7%至58%，含油率54.7%至57.7%，风味佳，品质优。
“双果”。坚果较大，长扁圆形，果壳白色或微显浅黄，较软，平均重1.8克至2.2克，出仁率54%，含油率59.2%，仁饱满，味香甜，品质优。
“鹰嘴”。坚果较大，扁圆锥形，先端尖，稍弯曲，形似鹰嘴。果壳厚，浅黄褐色，较光滑，平均重1.9克和2.0克，出仁率50.2%，含油率50%。仁饱满，棕褐色，味香，品质上，适合加工取仁。早果丰产性好，可作主栽品种。
“克西”。坚果大型，壳较软，浅棕色，壳厚，不易开裂，平均重2.5克，出仁率47%，含油率51%，仁饱满，棕黄色，味浓甜，品质中上。克西早，果性强，果型大，外观好看，味道香甜，宜带壳销售生食，或取仁加工。
“那普瑞尔”，又名浓帕尔。美国主栽品种。该品种果个大而整齐，果仁表面光滑，浅褐色，外观好。外壳簿如纸，出仁率60%至70%，但外壳密封不严，果仁易受鸟、虫侵害。花期早，成熟早，较抗晚霜。
“米森”。坚果果形特大，外壳坚硬，封闭严，商品性好，出仁率40%至45%，抗鸟、虫侵害能力强。果仁饱满，平均重1.0克至1.1克，略带苦味。